1978年，鄂西北奇异动物科学考察队在神农架采集到2只金丝猴标本。
1979年，神农架金丝猴被学术界发现。
1980年，华东师范大学刘民壮首次报道神农架有金丝猴的分布。
1986年，神农架自然保护区与华中师范大学生物系杨其仁教授合作对神农架金丝猴的数量及分布进行初步调查，开启了神农架金丝猴的学术研究。
1989年10月～1990年5月,神农架自然保护区朱兆泉、贺德贵等与华中师范大学杨其仁教授合作采用野外跟踪直数的方法对神农架金丝猴的种群、数量、分布、种群结构进行调查。报道神农架有金丝猴2 群,数量501只,栖息面积85平方公里,分布密度为3. 53只/平方公里。
1995年，神农架自然保护区与中科院动物所李义明研究员、刘学聪博士合作开展了神农架金丝猴野外生存力和栖息地需要等项目研究，目前合作研究仍在继续。
1996年，神农架自然保护区与北京大学心理系任仁眉、苏彦捷、严康慧等对金丝猴开展合作研究。对神农架金丝猴社会行为及行为生态学进行了研究，2005年著书《神农架金丝猴社会》。
1998年，神农架自然保护区在GEF项目的支持下，对神农架金丝猴进行了调查，数量为780只。
2005年，神农架自然保护区成立金丝猴保护研究中心，开展神农架金丝猴种群数量调查、人工补食试验，搭建了神农架金丝猴研究平台。
2005年4月～2006年4月,神农架自然保护区对神农架金丝猴的分布及种群数量进行全面调查，初步统计，神农架自然保护区内现有金丝猴3 个大群体,即金猴岭群体、大龙潭群体和千家坪群体, 8个小种群,数量共1282只。分布在海拔1600～3000米之间的针阔叶混交林和针叶林中,分布区范围210平方公里 ,分布密度6.18只/平方公里。
2006年以后，神农架自然保护区与北京林业大学张志祥、鲍卫东教授合作开展神农架金丝猴栖息地及行为等研究。
2007年，大龙潭研究基地充分利用平台优势与众多国内外科研机构开展了种群生态学研究、金丝猴栖息地评价研究和金丝猴人工辅助繁育等方面的研究，并在观音洞和千家坪建立了野外监测站和野外观测栈道，建立了金丝猴视频监控系统和视频展示中心，完善了金丝猴人工辅助繁育基地，建立了金丝猴越冬食物补给基地，启动了官门山野生动物救护中心。
2007年12月，经湖北省人民政府同意，湖北省科技厅评批准成立湖北省金丝猴保护研究中心。
2008年，神农架自然保护区与中国林业科学研究院合作开展了金丝猴栖息地植物群落、伴生动物和基于分子生物学保护遗传学研究。
2009年，神农架自然保护区与中南林业科技大学合作金丝猴疾病及繁殖行为研究。
2011年，成立了“国家林业局（神农架）金丝猴研究基地”。
2011年12月，湖北省科技厅批准建立“神农架金丝猴保育生物学省级重点实验室”，创建内容涵盖金丝猴保护遗传学、保护生物学等领域。
2012年2月23日，国家林业局批准建立“国家林业局（神农架）金丝猴研究基地”，这是我国首个建立的专门研究金丝猴的机构。
2018年6月20日至2019年6月20日，神农架国家公园科学研究院进行第三次川金丝猴摸底调查。共有10个种群，数量1470余只，主要分布在神农架区域内的大小千家坪、大小神农架、金猴岭、大龙潭、罗圈套等海拔1680～3000米针阔混交林中，分布范围350平方公里。
2018年至今，科学研究院立足自然资源优势和长期的科研积累,创建国家林草局神农架金丝猴研究基地、湖北省重点实验室和野外观测站等省部级科研平台，实现神农架林区省级科研创新平台“零突破”。省级重点实验室在2018年全省148个评估中排列29位，评定为优秀等次；野外观测站在2020年、2021年连续两年全省50个观测站中评估中排列前6位，被评定为优秀等次。
2019年，神农架国家公园获批“全国自然教育基地”。
2021年，与中国林科院等单位合作联合申创，成为“国家林草局生物多样性保护创新联盟”理事单位之一，为全面开展神农架地区生物多样性保护研究奠定了坚实基础。先后与中科院、华中农业大学等30余所高等院校和科研机构建立区校长期合作模式，使省级重点实验室和野外观测研究站实现了资源共享，形成开放合作、协同发展的运行机制。
2021年，神农架国家公园获批“全国林草科普基地”。
